堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。　　园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。　　然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，绝对音感成为了唯一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。

《战栗的乐谱》讲述的是钢琴调音师谱和先生对音乐的热爱被人破坏，又遭受其它的打击，对生活感到绝望，然后产生恨意连续杀人以至于想炸毁音乐厅和听音乐的人的事情。后来看到他之前放过的女孩返回音乐厅来唱《奇异恩典》阻止爆炸，他说看来当时应该除掉她的。柯南说：“你除不掉的，就因为这能激发人心热情的歌声，才让你犹豫了是吧？而且这首歌是你儿子生前最爱的歌曲，而唱歌的人，也是你儿子最爱的人。”柯南说：推理的关键在于音色差异，起先我以为声音有异，不过并不是那样，管风琴的某根音管中，被装入能感应气流的超小型感应器，因此造成音管的音色出现微妙的差异，当音管内的感应器，感应到气流通过，装设好的炸弹就会依序收到讯号，接着引爆。当最后一个炸弹引爆之后，这座音乐厅也会跟着崩塌。调音师问柯南怎么知道是他干的，柯南说：“绝对音感。你拥有绝对音感，可是，却没有在预演的时候指出管风琴声音有异常。就是因为这样才让我起疑心。”唱歌总是走调吓死人的柯南总是被叫作音痴，但他却总是能听出来哪个音有问题。当他被拥有绝对音感的歌唱家秋庭怜子称赞的时候，他说他听力不错。她说：“何止是不错，如果没猜错的话，你也有绝对音感。”他说真的有就好了。警察来了之后，那个调音师说能不能让他听完这首曲子，听完之后就可以说出一切真相。当被问为什么要在这座音乐厅里装上炸弹时，他说：“这35年来我一直都在担任堂本一挥的专属调音师，我的人生是跟他一同度过的。然而就在两年前，他突然宣布不弹钢琴了，开始弹管风琴，还希望我能够担任堂本音乐厅馆长。当然，我也可以拒绝他，可以自由选择，继续担任调音师，只是整整35年来，一直担任国际级钢琴家堂本一挥专属调音师的我，无意再在其他钢琴家工作，我的自尊不允许。但是我被绝望彻底地击垮。后来妻儿死去，也失去了唯一的生存目标，而身为调音师的我，这个时候已经落得一无所有，连原本如此深爱的音乐，也变成了刺耳，不协调的声音。我决定要除去这一切，为了找回宁静的夜晚，包含夺走我儿子性命的那四个人，自私的本堂，使他不再醉心钢琴的管风琴，以及堂本音乐厅。再加上，为了聆听管风琴演奏而来的全世界的音乐家与乐迷的性命。我也为跟我一同被本堂所舍弃的钢琴感到无比的痛心。”所以他将钢琴连同练习室一起炸掉，他认为这全是出于对钢琴的爱。说完那些之后，然后突然拿出一把枪，恶狠狠地说让人把堂本一挥给他找来，并且让柯南赶快离开这个房间。警察们让他冷静点，赶快放下枪，不要再伤人了。他说这把枪是为他自己准备的，他不会杀别人。柯南说：“我不。你明明犯下了重罪，还没有赎罪就想要寻死，我才不会让你做这种自私的事。”那时候堂本一挥进来说：“谱和，我很抱歉，我不晓得，你竟然会如此绝望。”他说：“你终于明白了吗？就是因为你的自私，才把我害得绝望。”堂本一挥说：“不是那样的，谱和。我之所以会退休，不再弹钢琴，是因为发现你的调音，开始出现些微的偏差，考虑到你的自尊，我无法对你指出这一点，不过问题是，我也无意和其它的调音师合作，所以才会决定，退休不弹钢琴了。”调音师根本不相信他的话，说那不可能，他有绝对音感。可是堂本一挥说相信他是拥有绝对音感没错，但是随着年岁增加，在他自己都没有觉察的情况下，音色常常会产生偏差的情况。早知道会这样的话，他应该说出事情才对的。他必须要向他道歉。调音师说现在道歉已经太迟了，这一切都是他的错。那时候园子突然很激愤地说：“你错了。我想如果我的挚友，她对我做出同样的事情，我会认为她是有不得已的苦衷，才会这么做的。说不定她之所以这么做，并不是为了她自己，而是为了我。我应该会这么想才对吧。因为，我相信跟我要好的挚友。”然后她问小兰对吧，小兰说她也是一样。她们两个很多次出生入死，是一对生死之交，常常让人感动。每一次成功避难都是因为有人和柯南之间绝对的信任和默契，不一定是小兰和小哀，也有其他初识的人。只有信任，才能配合默契。这一集也是，柯南和秋庭怜子被人打晕醒过来之后发现在一条船上，漂进了水库，堤坝很高根本无法上岸，叫喊有无人应答。柯南看到上面小房子外面墙壁上有个电话，就说他把话筒弄下来的时候他们发一些音拨打警局电话。他们练习了几次之后，柯南用足球打下话筒，两个人赶快和声成功拔打了电话，警察们用直升飞机救了他们之后，他们两个才能赶回去挽救了音乐厅和那么多人的性命。这次解除危机的关键，还在于小哀用直笛吹了一些音给柯南发暗号，柯南才能随机应变，配合警察的进攻。最后阿笠博士很惊讶地对小哀说，柯南竟然听得懂她用直笛吹的的暗号。小哀说：“将音名转换成英文字母，在推理小说中也出现过。他知道我母亲是英国人，才灵机一动推理出我用的是英式音名。接下来我们就只能相信他的绝对音感了。再说，身为他的伙伴，我相信他办得到。”风平浪静之后秋庭怜子和柯南小兰他们一起来到河边，三年前小兰和柯南闹别扭，走到那里的时候听到有人在唱歌，很受感动自然就和好了。小兰说在那样动人的歌声中早已经忘记了烦恼，只有感动。可是她想不起来到底是什么歌，后来在音乐会上，终于想起来就是那首《奇异恩典》，并且认出当年就是秋庭怜子在那里唱歌。——我以前经常和他一起来这里，因为这里是我们约会的路线。——原来是这样啊！——他因意外去世后的春天，我来到这个充满两个人回忆的地方，，唱了他最喜爱的歌。——就是那首《奇异恩典》。对不对？——没错。一开始，我简直是恨透了那四个人，甚至恨不得杀了他们，但是我选择原谅他们，因为奇异恩典这首歌，就是要人学会原谅。好了，我也该走了。柯南，下次再一起和声唱歌吧。我走了。她最爱的人虽然不是那几个人所杀，是因为酒后意外，但也和他们脱不开干系，很多人都会因此愤恨杀人的，但是她选择了原谅。因为她热爱音乐，真正热爱音乐的人不会绝望，更不会用音乐去犯罪的。调音师那么热爱音乐，却用音乐杀人。如果钢琴家不是采用放弃钢琴的方式来维护他的自尊，而是开诚布公的告诉他真想，也不至于让他感到背叛，陷入那样的绝望吧。原本应该是一个“高山流水”的故事，却弄成了仇恨和死亡。真是遗憾。我喜欢秋庭怜子这样的人，几次遭人暗算，后来脚踝受伤，却因为不想影响演出不让柯南报警，失去最爱的人也选择原谅不去仇恨，都是因为心中有对音乐强烈的爱，才会让人心灵美好向善。想起有人说我能够克服童年阴影，不再受影响是因为我的阴影不够阴暗。我不想辩解，虽然没有特别的阴影，但是对于敏感的人来很容易感受伤害，但我成年之后就能不再顾影自怜，不再找借口，也不是谁都可以做得到。只能说即使有很严重的阴影，也不会造成毁灭性永久性的伤害，因为我心中美好的东西超越了一切，让其它任何东西都无法真正摧毁我。就是那样。绝不矫情也不夸张。如果谁认为矫情的话，那我只能表示遗憾。